怀孕36天不可以进行药流。怀孕36天不建议进行药流,因为此时胚胎尚未成型,无法准确评估是否为宫内孕,盲目用药可能会对身体造成不必要的伤害。如果孕妇年龄超过40岁或存在心脏病、高血压等疾病史,则不适宜使用药物流产。药物流产后需注意观察阴道出血量以及是否有发热、头痛等症状出现,若异常应及时就医处理。