月经后复查卵巢囊肿有可能会消失。如果是生理性囊肿,如卵泡囊肿、黄体囊肿等,多与月经周期中的激素变化有关,月经结束后激素水平恢复正常,囊肿可能会自行消退。但若是病理性囊肿,如子宫内膜异位囊肿、囊腺瘤等,一般不会因月经结束而消失,通常需进一步检查和治疗。