肾结石碎石后第三天腰疼，可能是正常现象，也可能是体位原因、合并感染、结石未排出、合并腰椎间盘突出症等原因导致的，需要根据引起的原因进行针对性治疗。
1、正常现象
肾结石碎石后，可能会对肾脏黏膜造成一定的损伤，从而出现腰部疼痛的情况。这属于正常的现象，患者一般不需要过分担心，也不用进行特殊治疗，通常在一段时间后可自行缓解。
2、体位原因
如果患者在进行碎石手术后，长时间久坐或者久站，可能会导致局部血液循环不畅，从而引起腰部疼痛的情况。建议患者可以通过局部热敷的方式，促进血液循环，改善不适症状。
3、合并感染
如果在肾结石碎石后，患者没有做好局部的护理工作，导致细菌侵入，合并感染，也可能会引起腰部疼痛、尿频、尿急等症状。患者可以在医生指导下使用阿莫西林、左氧氟沙星等药物进行抗感染治疗。
4、结石未排出
如果肾结石体积较大，而且质地较硬，碎石可能无法将结石完全击碎，从而导致结石无法排出体外，从而引起上述情况。建议患者需要及时就医，可以通过体外冲击波碎石术等方式进行治疗。必要时，患者也可以通过手术的方式进行治疗。
5、合并腰椎间盘突出症
如果患者本身患有腰椎间盘突出症，而且肾结石碎石后，没有做好局部的护理工作，导致病情复发，可能会使患者出现腰疼、下肢麻木等情况。患者可以遵医嘱使用塞来昔布胶囊、双氯芬酸钠缓释片等药物缓解疼痛。
建议患者及时就医，明确具体病因后进行对症治疗，以免延误病情。
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