腰疼尿液颜色特别深可能是饮食因素、泌尿系统结石、肾炎等原因引起的，需要根据引起的原因进行治疗。
1、饮食因素
如果大量进食胡萝卜、橙子等食物，可能会导致尿液颜色加深，这属于正常现象，一般不需要特殊治疗。
2、泌尿系统结石
如果泌尿系统有结石，可能会导致尿液中的尿酸盐或者草酸盐含量增高，从而出现上述症状。可以遵医嘱使用排石颗粒、肾石通颗粒等药物治疗。必要时，可以通过体外冲击波碎石术治疗。
3、肾炎
如果患有肾炎，肾脏功能受到损伤，可能会导致体内的水分不能及时排出体外，从而引起上述情况。可以遵医嘱使用氢片、片等药物治疗。
除此之外，还可能与肾盂肾炎、肾小球肾炎等原因有关，建议及时就医治疗。
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