所有胸腺囊肿都应该手术切除以证实诊断。如果胸腺囊肿能从其位置、CT和其他影像特征中清楚地识别出来,囊肿可以通过经皮细针穿刺治愈。对于不能被诊断为胸腺囊肿的患者,手术是必要的,尤其是当胸腺瘤合并囊性变和包虫病不能完全排除时。