肛门彩超通常没有危害。
肛门彩超主要检查肛门周围疾病和直肠增生性疾病，还可以检查妇科疾病。肛门彩色多普勒超声可以了解肛门直肠部位是否有异常增生组织，是否有息肉、肿瘤等组织。可以了解息肉、肿瘤的大小、范围、浸润深度和表面血液循环。还可以了解肛肠周围间隙是否有脓肿，是否有肛瘘，判断肛瘘内口的原发性感染，这有利于手术期间的手术，还可以判断肛门周围肿块的性质。
随着技术的发展，经肛门彩色多普勒超声的应用越来越多，其诊断价值也越来越高，肛门彩色多普勒超声是一种无创检查，无明显副作用。
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