颅底脊索瘤的平均寿命大约在6.3年左右的。如果病人不接受任何治疗,平均预期寿命在半年到两年之间。因此,对于颅底脊索瘤患者需要早期的医疗干预。由于脊索瘤预后不好,早期治疗可提高生存率。目前,脊索瘤提倡手术切除和放射治疗。对于进行手术和放疗的病人,如果手术切除不彻底,5年内复发率可以高达100%。