闭经以后卵巢囊肿是否会自己消失，需要根据具体情况进行综合考虑。闭经后出现卵巢囊肿，可能是生理性原因引起的，也可能是子宫内膜异位症、卵巢囊肿等原因导致的。
1、生理性原因
女性在闭经后，体内的雌激素分泌会出现异常，从而引起卵巢囊肿，这属于正常的生理现象，通常是不会自己消失的，随着年龄的不断增长，囊肿可能会逐渐增大。如果没有出现明显的不适症状，可以不用进行特殊治疗，但是要定期去医院进行复查。
2、子宫内膜异位症
如果女性在闭经后不注意自身的护理，频繁进行刮宫，可能会使子宫内膜进入盆腔等位置，从而出现卵巢囊肿的情况，此时可能会自己消失。建议患者可以遵医嘱使用甲地孕酮片、己烯雌酚片等药物进行治疗，也可以通过腹腔镜手术进行处理。
3、卵巢囊肿
如果卵巢囊肿的体积比较大，而且是生理性原因引起的，可能会出现下腹部不舒服的情况，甚至还会伴有月经紊乱的症状，此时可能不会自己消失。可以通过卵巢囊肿剥除手术的方式进行治疗，也可以通过定期复查的方式进行改善。
除此之外，也有可能是子宫肌瘤、子宫腺肌症等原因造成的，需要及时去医院进行检查并治疗。
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