由于胚窦瘤生长较快,容易发生囊破裂和腹腔内植入。症状有腹部肿块,腹痛。肿瘤坏死和出血可以增加体温并有发烧症状。少数患者因胸腔积液而憋气,但胸腔积液并不意味着胸腔转移。有些人在手术后10到14天就消失了。患者的卵巢功能一般正常,少数患者有短期闭经或月经稀少。产前生长一般是正常的,大多数已婚人士都有过怀孕。个别患者同时发现了一个怀孕的肿瘤。由于高度恶性和疾病的快速进展,卵巢内胚窦瘤的转移发生率很高。