磁共振并非脑出血后首选检查手段，因为它对出血后的反应复杂多变。
出血后，随着血块体积随时间变化，磁共振图像也会相应改变。在超急性阶段（少于24小时），T1显示等信号，T2则稍高。进入急性期（1-3天），T1变为较低信号，T2呈现极低信号。到了亚急性早期（超过3天），T1转为高信号，T2依旧极低；亚急性后期（超过7天），两者都变成极高信号。到慢性期（超过两周），血肿中心T1是等信号，T2微高，而周边区域则是T1低信号，T2极低。了解这些特征有助于更准确解读影像结果。
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