免疫功能低下为隐球菌发病的重要诱因。正常人吸入隐球菌后,引起肺内感染,病变多仅局限于肺部,很少出现症状,常有自我愈合倾向。若因过度劳累或有免疫缺损的慢性病患者(如晚期恶性肿瘤、广谱抗生素及抗癌药等治疗),吸入真菌后在肺内形成病灶,可经血行播散至整个身子,且多侵入中枢神经系统。对于免疫功能低下的病人因病变极易由肺播散到中枢神经系统所以即使其脑脊液检查还是阴性结果,亦应及早开始系统治疗。治疗中以两性霉素B作为首选药物。

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