患者出现状况时，需要及时进行了解和治疗。眼角膜溃疡会复发，真菌性角膜溃疡早期可用药物治疗。常用的有氟康唑滴眼液和纳他霉素滴眼液。口服伏立康唑，静脉注射氟康唑。真菌性角膜溃疡的药物治疗是缓慢的，现有药物非常有限。如果真菌性角膜溃疡的药物治疗无效，应选择手术治疗。最常用的手术方法是结膜覆盖手术和角膜。
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