打完乙肝疫苗以后是可以吃抗生素的。但是在注射完乙肝疫苗以后,有一些孩子可能会出现一些副作用,例如发烧这个时候是正常的反应,并不一定需要使用抗生素,如果是发烧超过了38.5度,需要在医生的指导下口服退烧药物或者使用退烧贴治疗。