根据您的病情描述来看,膀胱灌注治疗后尿液检查出现鳞状上皮细胞及潜血,这种情况考虑有可能和药物对膀胱壁的刺激作用有关系。氟尿嘧啶膀胱灌注治疗的副作用是会出现血尿、尿频、膀胱部位疼痛等。膀胱灌注治疗一般用于腺性膀胱炎,以及膀胱肿瘤等疾病。建议多喝水,对症治疗即可,可以配合着一些消炎药物治疗。