巧克力囊肿手术以后一般是可以怀孕的。巧克力囊肿是一种良性囊肿,一般通过腹腔镜手术来进行治疗。治疗后保留卵巢,就可以保持女性的生育能力。巧克力囊肿手术完成后,也要定期进行复查。巧克力囊肿的患者在手术康复后最好恢复半年后再怀孕,这样可以让身体处于最佳状态下怀孕,对女性身体的伤害和影响会比较小。