病情分析：精子畸形率99可能能自然怀孕 。精子畸形率高达99%并不意味着精子头部有缺陷，也不能确定患者能否使配偶正常怀孕，因此患者不应惊慌。若其备孕时间较短，应尝试正常怀孕，若能正常怀孕，则表明精子具有正常的受孕能力。如果经过一年的正常准备仍不能怀孕，则应采取相应的治疗措施，如改变生活和工作方式、药物治疗等。