通常情况下，稽留流产药流后排出孕囊不一定就干净。
稽留流产是指胚胎停止发育，但仍有少量的活性组织物残留宫腔内，需要通过清宫手术进行治疗。而药流是指通过药物的方式终止妊娠，常用的药物有米非司酮片、米索前列醇片等。如果患者在进行药流后，宫腔内的残留组织较少，且患者对药物比较敏感，则可能会在药流后较快地排出孕囊，因此，这种情况下，稽留流产药流后排出孕囊可能就干净。但如果患者的残留组织较多，且患者对药物不敏感，则可能药流后排出孕囊的时间会相对较长，这种情况下，稽留流产药流后排出孕囊可能就不干净。
建议患者在进行药流后需要注意多休息，避免过度劳累，以免影响身体的恢复。同时，患者在药流后1个月内需要避免进行性生活，以免引起感染的情况发生。另外，如果患者出现不适症状，建议及时前往医院就诊治疗。
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