肛门上方有个小洞一般不能自愈。肛门上方有个小洞一般考虑为肛瘘外口 ,是一种肛周感染性疾病,主要是由于肛周脓肿破溃发展而来的。如果确诊为肛瘘,通常需要选择进行手术治疗,因为非手术治疗不能将疾病治愈。如果是低位单纯肛瘘,手术时间比较短,且术后复发率低。如果是高位复杂肛瘘手术,在术后复发率比较高。