颅咽管瘤一般是组织分化异常、外胚叶形成颅咽管残余等 。颅咽管瘤主要由外胚叶形成的颅咽管残余上皮细胞发展而来,肿瘤细胞实质是胚胎残余组织。颅咽管瘤会导致室间孔堵塞,影响脑脊液正常循环,造成颅内压升高,患者有持续恶心、呕吐症状。另外还可导致内分泌的紊乱,例如压迫垂体,导致生长激素分泌减少,出现生长发育迟缓。