睾丸隐隐作痛是否会自愈，需要根据引起的原因进行判断。通常睾丸隐隐作痛是由于睾丸炎、阴囊炎、睾丸扭转等原因所引起的。
1、睾丸炎
睾丸炎通常是由于细菌或病毒感染所引起的，由于炎症刺激会导致睾丸组织出现肿胀、隐隐作痛等症状。对于症状较轻的患者，通常可以自愈，不需要进行特殊治疗，但对于症状较严重的患者，则需要在医生指导下使用盐酸左氧氟沙星、盐酸莫西沙星等药物进行治疗。
2、阴囊炎
阴囊炎是由于内裤不透气、阴囊皮肤感染等原因所引起的炎症性疾病，由于炎症刺激会导致睾丸出现隐隐作痛的症状。通常阴囊炎的患者可以自愈，但如果患者症状较严重，则需要在医生指导下使用红霉素软膏、莫匹罗星软膏等药物进行治疗。
3、睾丸扭转
睾丸扭转主要是由于睾丸与精索发生扭转，导致睾丸血液供应出现异常，由于睾丸血液供应异常，会导致睾丸出现隐隐作痛的症状。通常睾丸扭转的患者需要及时就医，在医生指导下进行手法复位或手术复位，如果手法复位失败，可遵医嘱通过手术进行治疗，防止睾丸缺血坏死。
除此之外，睾丸隐隐作痛还可能是由于睾丸肿瘤、睾丸囊肿等原因引起的，建议患者及时就医，明确具体病因后进行对症治疗。
