先天性肛门闭锁手术后扩肛要三个月左右 。但是具体扩肛时间还存在一定差异性,患者如果存在先天性肛门闭锁,主要就是通过手术进行治疗,在手术之后也一定要注意加强护理,加强换药,避免发生感染也要避免出现肛门狭窄。同时要做提肛运动,促进局部血液循环,有利于减轻周围黏膜水肿。