枯草杆菌二联活菌颗粒和三联的区别在于:枯草杆菌二联活菌颗粒含有枯草杆菌和肠球菌两种活菌 ,而三联含有双歧杆菌、嗜酸乳杆菌、粪肠球菌三种活菌。两种药都是医治肠道菌群失调引起的腹胀、腹泻等肠道炎症或消化不良等疾病。两种药择一服用即可,合并服用可能会产生药物的相互作用。