脊索瘤与颅内脊索瘤的主要不同为疾病症状不同 。如果是颅内脊索瘤,会出现头痛、脑干压迫症状、脑神经麻痹及其他症状。如果是骶部脊索瘤,患者可能会出现疼痛、局部神经根受压和括约肌功能障碍的症状。且骶部脊索瘤可通过特征影像分辨,表现为骶骨中线部位有数个节段性破坏,且前方存在软组织肿块。