女性生殖疱疹和毛囊炎的区别在于病因、临床表现和治疗不同。外阴疱疹是由病毒感染引起 ,可表现为片状红斑和簇状水疱,抗病毒治疗是主要治疗方法。毛囊炎是由金黄色葡萄球菌、表皮链球菌感染、毛囊及毛囊周围组织引起的传染病,可表现为红斑、丘疹和疼痛症状,在治疗中,可以给予抗感染治疗。