双肾多发囊肿要根据患者的具体情况进行治疗。多发性肾囊肿通常是先天性疾病,是肾脏的良性病变,正常情况下是不需要治疗。而当多发性肾囊肿当中,会有单个囊肿的直径大于五厘米或者出现临床症状,例如疼痛,对周围组织或器官造成压迫症状、肾功指标不正常等。这时只能将比较大的或者对周围产生症状的囊肿,选择性地进行治疗。