韦格纳肉芽肿主要使用药物进行治疗。通常是使用糖皮质激素,需要大剂量的激素,联合免疫抑制剂进行治疗。一般选用的免疫抑制剂是环磷酰胺,或者硫唑嘌呤,甲氨蝶蛉等。如果是危重症患者,还可以静脉输注人免疫球蛋白,以增强抗病毒能力。此外,还可以使用辅助复方新诺明片进行抗感染的治疗。