角膜移植以后可能会有后遗症。角膜一般属于免疫赦免区 ,因为角膜本身没有血管,许多与排斥反应有关的免疫成分存在于没有血管的血液中,也就是移植组织中很少暴露于抗体成分。如果排斥反应是急性,通常在几周甚至几个月内会复发,而慢性排斥反应甚至在几年或更长时间以后发生。