紫蔻丸和附子理中丸的区别在于功效、成分、治疗症状等不同。紫蔻丸具有温中行气、健胃消食等功效,由山楂、茯苓、草豆蔻、陈皮等中草药组成,常用于治疗寒郁气滞或饮食所致的消化不良、恶心呕吐、胃脘疼痛等病症。附子理中丸具有温中焦、健脾胃等功效,由人参、白术、干姜、附子等成分组成,用于治疗慢性胃肠炎、消化性溃疡、慢性消化不良等病症。