基底动脉型偏头痛可以通过药物来治疗。在治疗基底动脉偏头痛时,西医通常遵循对症治疗和预防治疗的原则。在疾病发作期,止痛治疗通常是主要治疗方法,而在疾病间歇期,预防性治疗通常是主要治疗方法。常见的治疗药物包括类固醇、抗炎镇痛药物和丙戊酸钠等抗癫痫药物,这两种药物适用于不经常发作且没有严重头痛的人。