亚甲蓝的作用是手术期间染色或术后止痛,用于肛周疾病。如痔疮手术,术前可从肛瘘外口注射亚甲蓝,亚甲蓝沿肛瘘口染色。下肛瘘可以清除所有的污渍区域,这样肛瘘就可以被清除。如果肛瘘内口较高,术中不易发现内口,也可用美蓝染色,便于寻找内口。手术后,由于肛门内有许多神经和血管,疼痛明显。亚甲蓝也可以注射到伤口周围的皮下,这可以达到疼痛缓解的效果。