巧克力囊肿不会自行消失,需治疗干预。这是因为巧克力囊肿是由于子宫内膜异位到卵巢内,随着月经周期的改变而增生、脱落和出血,形成囊肿。随着时间的推移,这些囊肿会逐渐增大,导致卵巢组织受到压迫和破坏,影响卵巢功能和生育能力。因此,巧克力囊肿需要通过药物治疗或手术干预来控制其生长和减少对身体的影响。