羊水穿刺的危害有宫内感染、刺伤胎儿、血液传染等 。如果手术前准妈有被感染的概率或在做完羊水穿刺术后没能及时做好清洁、卫生的工作,就会有宫内感染的现象出现。羊水穿刺过程中可能会出现刺伤胎儿的情况,一般刺伤也无大碍,会自行愈合。当孕妇和胎儿的血液发生接触时,如果孕妇的血液为RH阴性,并且胎儿的血液为RH阳性时,会出现危险。