通常情况下，去除扁平疣可以在医生指导下使用咪喹莫特乳膏、重组人干扰素α2b凝胶、氟尿嘧啶软膏等药膏。
1、咪喹莫特乳膏
扁平疣通常是由人乳头瘤病毒感染皮肤所引起的，可能与皮肤外伤、未注意个人卫生等因素有关，患者可能会出现扁平丘疹，表面光滑，质地比较硬。建议患者可以在医生的指导下使用咪喹莫特乳膏进行治疗，可以刺激局部皮肤，从而达到治疗的效果。
2、重组人干扰素α2b凝胶
这属于广谱抗病毒剂，可以抑制HPV感染的上皮细胞增殖，达到治疗疾病的效果，可以改善扁平疣引起的皮肤瘙痒、疼痛等症状。
3、氟尿嘧啶软膏
该药物可以通过抑制病毒的DNA合成，达到治疗疾病的效果，可以抑制肿瘤细胞的生长，有利于疾病的恢复。
除此之外，还可以遵医嘱使用维A酸乳膏、维生素E乳膏等药物。建议患者在医生的指导下使用药物，不可盲目用药，以免出现不适症状。
贵州省第二人民医院
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转移因子胶囊
用于治疗病毒性感染和自身免疫性疾病：1.皮肤病；扁平疣，带状疱疹，单纯疱疹，两周为一个疗程；银痟病，尖锐湿疣等，三个月为一个疗程；2.呼吸道疾病；反复感冒，支气管炎，哮喘，慢性支气管炎，过敏性鼻炎，流行性腮腺炎等，两周一个疗程；3.病毒性肝炎，肝硬化，流行性出血热等，三个月一个疗程；4.其他：（1）肾病综合征，类风湿性关节炎，过敏性紫癜，硬皮肤，红斑浪疮，溃疡病等，三个月一个疗程。（2）恶性肿瘤，肿瘤病人放化疗后的辅助治疗，一个月一个疗程。
五妙水仙膏
本品具有去腐生新，清热解毒的作用。主治扁平疣、各种痣、寻常疣(瘊子)、老年斑、血管瘤、汗管瘤、皮赘等皮肤疾病。
维A酸片
适用于痤疮、扁平苔藓、白斑、毛发红糠疹和面部糠疹等。可作为银屑病、鱼鳞病的辅助治疗，也可用于治疗多发性寻常疣以及角化异常类的各种皮肤病。同时用于治疗急性早幼粒细胞白血病（APL），并可作为维持治疗药物。
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