甲氨蝶呤一般需要2-4周的时间可以代谢干净，具体的时间需要根据患者的身体代谢情况进行判断，无法一概而论。
甲氨蝶呤是一种抗叶酸类药物，在临床上主要用于治疗乳腺癌、恶性葡萄胎、绒毛膜上皮癌、宫颈癌、银屑病等疾病。患者在使用甲氨蝶呤后，药物会通过肝脏和肾脏进行代谢，如果患者的身体代谢情况比较好，药物在体内的代谢速度也会比较快，一般在2周左右的时间可以代谢干净。但如果患者的身体代谢情况比较差，药物在体内的代谢速度也会比较慢，一般需要4周左右的时间才能代谢干净。
建议患者在使用甲氨蝶呤治疗疾病期间，需要严格遵医嘱用药，避免自行盲目用药，以免因用药不当引起不良后果。在用药期间，如果出现不适症状，建议患者及时就医治疗，以免延误病情。
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