双合诊检查一般是指直肠指检，直肠指检检查会疼通常是由于直肠受到刺激所引起的，但也可能是由于患者本身患有痔疮、肛裂等疾病导致的。
1、直肠受到刺激
直肠指检是一种常见的检查方式，医生会将手指放入患者的肛门内，通过触摸直肠的方式来判断是否存在病变。在进行直肠指检时，由于直肠部位受到刺激，患者可能会出现轻微疼痛的情况，但这种疼痛大多数是暂时性的，患者一般不需要进行特殊治疗，一般在休息后可逐渐缓解。
2、痔疮
痔疮通常是由于不良的排便习惯、长期便秘等原因导致肛门和直肠处的静脉压力升高，进而造成静脉肿大，形成痔疮。在进行直肠指检时，由于痔疮的存在，可能会导致肛门部位受到刺激，从而出现疼痛的情况。患者可以在医生指导下使用痔速宁片、马应龙麝香痔疮膏等药物进行治疗，对于病情严重的患者还可以通过手术治疗。
3、肛裂
肛裂通常是由于长期便秘、腹泻等原因导致肛管受到机械性损伤，进而形成溃疡。患者在进行直肠指检时，由于对肛门造成刺激，可能会出现疼痛的情况。患者可以在医生指导下使用硝酸甘油软膏、红霉素软膏等药物进行治疗，对于病情严重的患者还可以通过手术治疗。
除此之外，还可能是由于肠易激综合症、肛周脓肿等原因引起的，建议患者需要及时就医，根据不同的病因采取相应的治疗措施。
贵州省第二人民医院
北京大学第三医院
上海交通大学医学院附属瑞金医院
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