新生儿吞咽障碍是否能自愈，要取决于引起的原因，如果是生理性的，有可能会自愈，但如果是病理性的，可能无法自愈。
1、生理性
新生儿吞咽障碍可能是生理性的，主要是由于新生儿的消化系统发育还不完善，可能会出现食道反流的情况，从而引起新生儿出现吞咽障碍的症状。这种情况下一般随着年龄的增长，消化系统会逐渐完善，达到自愈的可能。
2、病理性
新生儿吞咽障碍也可能是病理性的，比如口腔疾病、咽喉部疾病等。口腔疾病主要是由于口腔畸形、口腔溃疡等原因导致的，会导致新生儿出现吞咽障碍的情况。这种情况下一般是不能自愈的，需要在医生的指导下进行针对性治疗，如口腔疾病可以通过手术进行治疗，咽喉部疾病可以遵医嘱使用阿莫西林、头孢克肟等药物进行治疗。
因此当新生儿出现吞咽障碍时，建议及时到医院进行检查，明确引起的原因后，在医生的指导下进行针对性治疗。
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