肺隐球菌感染治疗两年了，最后严重了，可能是治疗不当、免疫力低下、环境因素等原因导致的。
1、治疗不当
如果患者在治疗期间没有遵医嘱按时按量服药，或者没有遵医嘱定期去医院复查，则可能会导致治疗不当，使病情反复发作，从而严重损害身体健康。建议患者在治疗期间遵医嘱按时按量服药，并遵医嘱定期去医院复查。
2、免疫力低下
如果患者在治疗期间没有注意休息，而是经常熬夜，并且没有适当进行运动锻炼，则可能会导致免疫力低下，从而使病情更容易复发。建议患者在治疗期间注意休息，避免熬夜。同时，还可以适当进行运动，有助于增强免疫力。
3、环境因素
如果患者长期居住在潮湿、通风不佳的环境中，则可能会导致肺部吸入大量粉尘，从而诱发肺隐球菌感染。患者可以在医生的指导下使用伊曲康唑胶囊、氟康唑胶囊等药物进行治疗。
除此之外，还可能是患者本身存在肺结核、艾滋病等疾病导致的。建议患者及时就医，有利于明确病因，从而对症治疗。
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