肾结石5毫米在排出时一般不会引起疼痛。肾结石5毫米体积较小,通常不会卡在输尿管内,因此不会造成明显的梗阻和炎症反应,也就不会出现疼痛症状。若患者存在输尿管狭窄、尿路感染等情况,则可能导致肾结石5毫米排出时感到轻微不适或疼痛。此时需要及时就医,以免延误病情。对于肾结石患者,日常应多喝水促进排泄,同时避免摄入高钙食物,减少结石形成的风险。