小儿疱疹性咽峡炎可以在医生的指导下服用抗病毒药物、抗生素药物、清热解毒的药物、止惊的药物、退热药物等，具体需要明确病因后进行治疗。
1、抗病毒药物
小儿疱疹性咽峡炎主要是由于肠道病毒感染所引起的，通常会出现发热、咽痛、咳嗽等症状。建议患者可以在医生的指导下使用利巴韦林、阿昔洛韦等抗病毒药物进行治疗，可以抑制病毒在体内的复制，从而起到治疗的效果。
2、抗生素药物
如果小儿疱疹性咽峡炎合并细菌感染，建议患者可以在医生的指导下使用阿莫西林、头孢克肟等抗生素药物进行治疗，可以起到抗感染的作用。
3、清热解毒的药物
如果小儿疱疹性咽峡炎出现发热的症状，并且体温超过38.5°C，可以遵医嘱使用清热解毒的药物进行治疗，比如布洛芬混悬液、对乙酰氨基酚口服溶液等，可以促进体温恢复正常。
4、止惊的药物
如果小儿出现了明显的惊厥症状，如四肢抽搐、牙关紧闭等，可以在医生的指导下使用片、片等药物进行治疗，可以起到镇静的作用。
5、退热药物
如果小儿出现了发热的情况，并且体温超过了38.5°C，可以遵医嘱使用退热的药物进行治疗，比如布洛芬混悬液、对乙酰氨基酚口服溶液等，可以起到降温的作用。
建议家长及时带小儿去医院就医，以免延误病情。在治疗期间，小儿需要注意做好保暖措施，避免着凉，以免加重病情。
八宝惊风散
肠内营养混悬液(TPF)
安宫牛黄丸
