低位肛门闭锁手术后的恢复时间无法完全确定,与手术方式有关 。低位肛门闭锁患者通过一期直肠肛门血管成形术快速恢复。术后3~5天可进食一定量的食物,两周后可进食母乳和乳制品。中高位肛门闭锁合并严重畸形恢复时间长。患者需要进行临时性造瘘,三个月或三个月以上即可进行整形手术,有时甚至需要多次手术,恢复时间无法确定。