小儿脑炎腰穿一般不会有后遗症的 。小儿脑炎的确诊需要做腰椎穿刺检查,了解脑脊液压力是否正常,还需要留取脑脊液进行化验检查,明确脑炎具体的感染微生物。腰椎穿刺检查是神经内科常用的比较安全的有创检查项目之一。小儿脑炎患者,有的甚至需要多次做腰椎穿刺检查,来了解脑炎愈合情况。腰椎穿刺检查一般来说是比较安全的,不会对孩子发育和以后造成什么影响。