卵巢囊肿手术后来月经肚子疼可能是由于子宫内膜异位症或盆腔感染所引起 。卵巢囊肿手术以后,月经来的时候小肚子疼痛,建议患者首先做B超检查,查看是否患有子宫内膜异位症或有无盆腔积液,还需要做妇科检查。一般情况下,卵巢囊肿手术以后不会导致痛经的发生,子宫内膜异位症多发于卵巢和盆底部。在明确诊断后予以相应的治疗。