食管黑色素沉着可能是黑色素、黑色素类似物沉积引起的 。肉眼看到的颜色是棕色或深棕色,通常在出血后发现。除食道中的黑色素外,常见于十二指肠和大肠,少数也见于胃和小肠。食管外黑变病中的黑色素颗粒是含有铁和硫的蛋白质,大肠是脂褐素的色素类似物,与黑色素细胞产生的通常不同。