生殖疱疹复发时同房会传染。这是因为生殖疱疹是由单纯疱疹病毒引起的一种性传播疾病,当病毒在体内活跃时,它会通过皮肤或黏膜的微小损伤处进入身体,导致疱疹的出现。在疱疹出现时,病毒处于高度活跃状态,此时同房可能会导致病毒在伴侣之间传播。因此,为了避免传染,建议在生殖疱疹复发期间避免性接触,直到症状完全消失并经过医生确认不再具有传染性。