右侧附件巧克力囊肿可能影响怀孕。右侧附件巧克力囊肿是由子宫内膜细胞在卵巢中的异常生长所引起的,这些细胞可能会导致卵巢功能障碍、输卵管堵塞等问题,从而干扰正常的生殖过程,影响怀孕。如果巧克力囊肿体积较小且无症状,则通常不会影响怀孕;若患者存在不孕或反复流产等情况时,需考虑是否为巧克力囊肿所致。对于有生育需求的女性而言,建议定期监测巧克力囊肿的变化情况,并积极治疗原发病灶,以减少其对生育能力的影响。