先天性肛门闭锁孕检能查出来。通常在进行四维彩超检查时，如果胎儿位置适当，就可以发现肛门闭锁的情况。建议在怀孕过程中，一定要定期进行产检，并且要到正规的专科医院进行检查。如果患者对某些结果存在疑问，还可以进行复检，这样才能够有效地发现相关异常，并且及时地进行处理。
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