早晨小便里很多棉花，可能是尿道炎、肾小球肾炎、肾盂肾炎、膀胱炎、肾结石等疾病引起的，可通过药物、手术等方式进行治疗。
1、尿道炎
患者可能因尿道部位受到细菌感染诱发炎症，在炎症的刺激下，会导致尿道黏膜受损，出现尿血、尿道刺痒等症状，还会伴有尿液中有棉絮的情况。患者可遵医嘱口服盐酸左氧氟沙星胶囊、头孢克肟胶囊等药物进行改善，还要注意个人卫生，勤换内裤。
2、肾小球肾炎
可能因身体免疫力比较低，使肾小球受到细菌入侵诱发炎症，会出现血尿、蛋白尿、水肿等症状，还会伴有尿液中有棉絮的情况。患者可遵医嘱口服阿莫西林胶囊、青霉素V钾片等药物进行改善，还要注意多加休息，避免过度劳累。
3、肾盂肾炎
可能因身体免疫力比较低，使细菌通过尿道进入肾盂部位诱发肾盂肾炎，会出现腰痛、尿痛、尿频等症状，还会伴有尿液中有棉絮的情况。患者可遵医嘱口服头孢克肟胶囊、阿莫西林胶囊等药物进行改善，还要注意多加休息，避免过度劳累。
4、膀胱炎
可能因膀胱部位受到细菌入侵诱发膀胱炎，会出现尿频、尿急、尿痛等症状，还会伴有尿液中有棉絮的情况。患者可遵医嘱口服盐酸左氧氟沙星胶囊、头孢呋辛酯片等药物进行改善，还要注意合理膳食，避免吃辛辣油腻食物。
5、肾结石
如果患者本身患有肾结石，并且没有及时治疗，可能会导致结石体积逐渐增大，会使尿道部位受到压迫，从而出现尿血、腰部疼痛等症状，甚至还会伴有尿液中有棉絮的情况。建议患者可以去正规医院通过体外冲击波碎石术的方式进行治疗，术后还要注意多喝水，多排尿。
如果患者出现其他不适，建议及时去医院就医，明确疾病，对症治疗。
