先天性肾盂输尿管连接部梗阻的原因有很多，比如遗传因素、基因突变、炎症刺激等。
1、遗传因素
如果父母双方或者一方有先天性肾盂输尿管连接部梗阻的情况，子女患病的概率可能会比较高。
2、基因突变
如果在怀孕期间，孕妇长时间吸烟、喝酒或者服用某些药物，可能会导致胎儿基因突变，引起先天性肾盂输尿管连接部梗阻的情况。
3、炎症刺激
如果在怀孕期间，孕妇长时间生活在污染的环境中，或者受到病毒、细菌等病原体感染，可能会对肾脏造成损伤，进而引起先天性肾盂输尿管连接部梗阻的情况。
除此之外，还可能与内在因素、外在因素等有关，建议患者及时就医治疗，以免延误病情。
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