怀孕46天只有孕囊没有发现卵黄囊和胎心胎芽，可能是正常现象，也可能是胚胎停育、异位妊娠、生化妊娠、葡萄胎等原因引起的，需要根据不同的原因选择合理的处理方法。
1、正常现象
怀孕46天，时间比较短，孕囊还没有发育成熟，可能在检查时发现只有孕囊没有发现卵黄囊和胎心胎芽。如果没有出现腹痛、阴道出血等症状，一般是正常现象，可以等到7天左右再次到医院进行复查。
2、胚胎停育
如果胚胎染色体异常，或者是孕妇感染风疹病毒、巨细胞病毒等，可能会导致胚胎停育，从而出现上述情况。建议患者及时就医，可以通过妇科彩超、血HCG检查等方式明确诊断。如果确诊为胚胎停育，则可以在医生指导下通过药物流产、人工流产等方式终止妊娠。
3、异位妊娠
如果受精卵着床在子宫腔以外的位置，随着受精卵的生长发育，可能会导致孕囊破裂，从而出现上述情况。建议患者可以通过腹腔镜手术进行治疗。必要时，患者也可以通过输卵管切除术等方式进行手术治疗。
4、生化妊娠
如果胚胎染色体异常，或者是孕妇受到病毒感染，可能会导致胚胎停止发育，引起生化妊娠，从而出现上述现象。建议患者及时就医，可以通过妇科彩超、血HCG检查等方式明确诊断。如果确诊为生化妊娠，则不需要进行特殊治疗，建议患者注意休息，避免过度劳累，以免引起不适症状。
5、葡萄胎
如果受精卵异常、孕妇营养不良等，可能会导致胚胎发育异常，引起葡萄胎，从而出现上述现象。建议患者及时就医，可以通过人绒毛膜测定、妇科彩超等方式明确诊断。如果确诊为葡萄胎，则需要通过清宫术、子宫切除术等方式进行治疗。
建议患者及时就医，可以通过血常规检查、尿常规检查等方式明确诊断。在日常生活中，患者应注意保持良好的生活习惯，避免过度劳累，以免引起不适症状。
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