月经过后第三天同房是否会怀孕，需要根据具体情况判断。如果女性月经周期比较规律，排卵期也比较规律，在月经过后的第三天同房，怀孕的概率会比较高。如果女性的月经周期不规律，排卵期也会不规律，在月经过后的第三天同房，怀孕的概率可能会相对较低。
如果女性的月经周期比较规律，在28~30天，在月经过后的第三天，大约进入了排卵期，此时同房怀孕的概率会相对较高。如果女性的月经周期不规律，可能无法准确地推算排卵期，在月经过后的第三天同房，也有可能会出现怀孕的情况。
如果夫妻双方没有做好怀孕的准备，在同房时需要做好安全措施，佩戴避孕套，以免出现意外怀孕的情况。在日常生活中，还要保持良好的生活习惯，避免长期熬夜，以免出现内分泌失调的情况。如果夫妻双方没有生育的需求，在同房时需要正确佩戴避孕套，也可以在医生的指导下服用避孕药，以免出现意外怀孕的情况。
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